#fq_qc_web — 浏览器端 FASTQ 质控仪表盘

FastQC 风格的纯前端 FASTQ 质控报告：MoonBit 计算（src/fqqc.mbt），HTML/SVG 渲染，测序数据不出本机。

#使用

# 1. 生成报告(演示数据, 内含质量衰减/adapter 污染/GC 偏置特征)
cd examples/fq_qc_web
moon run . -- --demo > report.json 2>/dev/null

# 或分析真实数据
moon run . -- "$(cat sample.fq)" > report.json

# 2. 本地起服务并打开(file:// 协议下 fetch 受限)
python3 -m http.server 8000
# 浏览器访问 http://localhost:8000/examples/fq_qc_web/index.html

#报告模块（对齐 FastQC）

模块	说明
Basic Statistics	reads / 碱基 / 均长 / 平均 GC
Per base quality	逐位质量箱线（低/四分/中位/四分/高），绿黄红区带
Per sequence quality	序列平均质量直方图
Per sequence GC	序列 GC 分布（混样/污染时出现双峰）
Per base GC	逐位 GC 折线
Length distribution	读长分布
Adapter content	Illumina adapter / polyG 前缀命中
Overrepresented sequences	高频重复序列 Top 20